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R et les modèles de durée


Cette page est consacrée à la description de l'utilisation de R dans le cadre de modèles de durée.

Une page de ressources (fichiers et packages) lui est associée.

Modèles multiplicatifs (Cox)

Contexte


Comme pour Kaplan-Meier, on dispose de données "tête par tête" sur une période d'observation fixée et on souhaite positionner les fonctions de hasard de sous-populations les unes par rapport au autres dans le cadre d'une hypothèse de hasard proportionnel, et sans nécessairement spécifier la fonction de hasard de base.

Références

Support de cours sur la "Statistique des modèles de durée paramétriques et semi-paramétriques".

Mise en oeuvre

Le modèle de Cox fait appel à la procédure :

res=coxph(Surv(Entree,Sortie,NonCensure,type="counting") ~ var1 + var2 + var3 + ...)

L'hypothèse de hasard proportionnel peut être testée via :

cox.zph(res)

Liens extérieurs

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Scripts écrits par Frédéric PLANCHET et Marc JUILLARD © 2007-2009